W czasie sigmoidoskopii używa się metalowej lub plastikowej rury, zwanej sigmoidoskopem, w celu zbadania dolnego odcinka jelita grubego. Badanie to może być pomocne w wykryciu przyczyny krwawienia z odbytnicy, a także przyczyny biegunki.

Podczas tego zabiegu pacjenta prosi się, by położył się na boku z nogami podkurczonymi pod klatkę piersiową. Sigmoidoskop wprowadza się do jelita grubego przez odbyt. Aby lepiej uwidocznić powierzchnię jelita, do wnętrza wprowadza się powietrze. Do badania można pobrać mały fragment tkanki odbytnicy (biopsja).

Sigmoidoskopia jest badaniem bezbolesnym, ale nieprzyjemnym. Jest to jednak jedyny sposób rozpoznania niektórych przyczyn biegunki w zaawansowanym zakażeniu wirusem HIV. Badanie to trwa około 5 minut.